Обидва варіанти вірні. Різниця стилістична: заборонено – нейтральне слово, заборонено – офіційне.

У чому різниця між заборонено і заборонено?

Різниці у значенні немає. Але ці слова різняться стилістично: заборонити – нейтральне, заборонити – офіційне. Слово "заборонити" ми можемо використовувати і в живому мовленні (наприклад, батьки можуть сказати дитині "забороняю тобі"). А "заперечити" в живій мові недоречно.

Як правильно написати стороннім вхід заборонено?

Сюди стороннім вхід заборонений.